1樓:派森諾生物
如果您指的是dna二代測序建庫時需要打斷成特定長度的片段的話,是因為不同儀器的測序讀長是不一樣的,因此在建庫過程中所需要的插入片段長度也有一定的限制,比如對於illumina平臺來說,dna插入片段的長度一般在400-500bp左右,如需測通的話,這個片段長度要進一步剪短至讀長範圍內;如果是454測序的話,一般插入片段長度可以達到1kb以上的。
對於illumina 平臺而言,有單端測序和雙端測序兩種,具體是指在測序過程中,只讀取文庫一端的序列,還是文庫兩端對讀,而採用哪種讀取模式主要還是根據測序要求的需要來定。
2樓:
因為 現有的機器沒那麼先進 沒測一個鹼基都有一定的誤差 比如準確率是0.99 連測10個 第十個準確率就是0.99的10次方就是0.
87左右了 再多測可想而知 測得越多準確率越低 所以 剪成小段 保證小段高準確率 再拼成長鏈
3樓:
您是指測序結果是800bp左右片段嗎,由於測序儀毛細管解析度的大小,只能讀出850bp的鹼基,所以較長的序列需要根據測序結果walking設計合成引物後繼續測序,且dna序列並沒有剪成小片段,以上解釋只限於一代測序,不知道您是指一代測序還是二代?
為什麼dna測序需要剪成小段呢是因為只能
4樓:匿名使用者
如果您指的是dna二代測序建庫時需要打斷成特定長度的片段的話,是因為不同儀器的測序讀長是不一樣的,因此在建庫過程中所需要的插入片段長度也有一定的限制,比如對於illumina平臺來說,dna插入片段的長度一般在400-500bp左右,如需測通的話,這個片段長度要進一步剪短至讀長範圍內;如果是454測序的話,一般插入片段長度可以達到1kb以上的. 對於illumina 平臺而言,有單端測序和雙端測序兩種,具體是指在測序過程中,只讀取文庫一端的序列,還是文庫兩端對讀,而採用哪種讀取模式主要還是根據測序要求的需要來定.
5樓:oo紫軒
dna測序打斷的範圍一般在200-300bp左右,之所以這麼做是由測序儀讀取的片段長度所決定的。目前illumina的測序儀中miseq系列的讀長為2x300bp,nextseq的讀長為2x150bp。每個系列讀長可自行去illumina官網檢視。
二代測序為什麼需要構建dna文庫
6樓:匿名使用者
1)測序文庫的構建(library construction)首先準備基因組(雖然測序公司要求樣品量要達到200ng,但是gnome analyzer系統所需的樣品量可低至100ng,能應用在很多樣品有限的實驗中),然後將dna隨機片段化成幾百鹼基或更短的小片段,並在兩頭加上特定的接頭(adaptor)。如果是轉錄組測序,則文庫的構建要相對麻煩些,rn**段化之後需反轉成cdna,然後加上接頭,或者先將rna反轉成cdna,然後再片段化並加上接頭。片段的大小(insert size)對於後面的資料分析有影響,可根據需要來選擇。
對於基因組測序來說,通常會選擇幾種不同的insert size,以便在組裝(assembly)的時候獲得更多的資訊。
2)錨定橋接(su***ce attachment and bridge amplification)
solexa測序的反應在叫做flow cell的玻璃管中進行,flow cell又被細分成8個lane,每個lane的內表面有無數的被固定的單連結頭。上述步驟得到的帶接頭的dna 片段變性成單鏈後與測序通道上的接頭引物結合形成橋狀結構,以供後續的預擴增使用。
什麼時候單端 什麼時候雙端測序
7樓:smile我的愛人
要看你的來測序長度和生物
源資訊的分析方法,同時由於測序長度越長,錯誤率會升高,一般測超過300bp的都是雙端測序的,現在miseq的測序長度比較長;而從準確度來說,單端300bp的錯誤率會比雙端150bp高,單端150bp比雙端75bp高,大概這樣
dna測序時為什麼只用一個引物
8樓:匿名使用者
dna測序是單向測序,和測通的區別
dna測序一個反映大約可以測800bp左右,如果所測目的序列在800bp左右,則一個反映就可以測通,即完成測序;
如果序列大於800bp,如1500bp,則需要兩個反應才可以完成測序,兩個反應的測序中間是有相同的部分,故需要拼接.
如果是pcr,那麼由於測序原理的原因,引物後面的一段序列是讀不出來的,這樣的話,你做單向測序,那麼最開始的引物後面那一段序列是沒有的,這時候就需要從另一端進行測序,那麼就是選擇測通就可以了。
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