1樓：百度文庫精選
內容來自使用者:秋葉麒麟
聚類樹構建及繪圖
gaom
在選擇樣品進行分析時，我們常常會根據樣品的一些特徵值，對樣品本身進行聚類，以此判斷樣品之間的關係。在r語言中常見的聚類演算法主要有層次聚類和動態聚類。其中我們常說的k-means聚類就是動態聚類。
今天我們通過例項操作展示一下，利用r進行聚類分析的過程。這次用的資料還是上次pca分析時用的資料。
data<-read.table(file ="c:/users/gaom/desktop/聚類分析/test_data.
txt",sep="\t",header =t,row.names =1)#首先還是匯入資料，row.names=1,表示第一列作為行名dim(data)
## [1] 2999 12
head(data)
## t01 t02 t03 t04 t05 t06## 1007_s_at 10.198586 11.805676 10.
867953 11.763660 12.072232 12.
108312## 1053_at 9.594074 8.713108 9.
247096 9.433265 9.092329 9.
005518## 117_at 8.581763 8.603680 8.
804425 8.661700 8.634979 8.
606976## 121_at 12.022315 12.655329 12.
627334 12.791390 12.961761 12.
885307## 1255_g_at 7.228569 7.214600 7.
237131 7.293417 7.276799 7.
268233## 1294_at 8.828487 9.380277 9.
297989 8.858985 8.995772 9.
126825## t07 t08 t09 t10 t11 t12## 1007_s_at 10.646868 10.852744 10.
675898 11.137663 10.796737 11.
102408## 1053_at 9.087681 9.027208 8.
965283
用r語言進行聚類分析不畫影象怎樣輸出結果
2樓：匿名使用者
今天看了決策樹的用法，個人覺得不管是分類或聚類演算法，出來的結果是一個「規則」。至於要怎麼去分類資料，是根據這個「規則」 來做的。所以，提取資料是另外一個工作了。
## 更新日期：2015/11/11前段時間在做聚類分析，用到hclust() 函式，將資料聚類分組後，對應到每一個id。具體如下：
d = dist(testdata, method = "euclidean") hcward = hclust(d, method="ward.d") data$groups = cutree(hcward,k=8) # 到這裡，data 中的每個id都對應到相應的group 了
資料分析用python還是r語言
python與r語言的共同點 python和r在資料分析和資料探勘方面都有比較專業和全面的模組，很多常用的功能，比如矩陣運算 向量運算等都有比較高階的用法。python和r兩門語言有許多平臺適應性，linux windows都可以用，並且 可移植性強。python和r比較貼近matlab以及mini...
R語言中是什麼意思，R語言程式碼裡的英文句號「 」有什麼含義麼
風翼殘念 是s3類的引用方式，是s4類的引用方式。比較常用，比較少用。通常我們的data.frame,list.向量等用 就可以。s4也有例如，有個維恩包vennerable s4型別，想取得裡面intersectionsets，資訊必須用 符號。當一個函式裡需要返回多個值 比如有變數，有向量，有矩...
r語言如何獲取某一列的數值範圍，r語言中如何從一組資料篩選出符合條件的值，求R的篩選code
會飛的小兔子 用fgets函式讀取檔案中某行的資料，某列資料就必須讀入每行的第幾個字元，再存入到一個字串當裡。例 include include voidmain chara 100 b 100 c 100 inti 3,j 4,k 0 第三行，第四列 file fp fopen data.txt ...