鹼裂解法原理,鹼裂解法大量提取質粒是什麼原理?

時間 2021-09-02 20:47:42

1樓:科普小星球

鹼裂解法的原理是:高ph 的溶液會使細胞壁粕類從而使得dna和蛋白質變性。

將細菌懸浮液暴露於高ph值的強陰離子洗滌劑中,會使細胞壁破裂,染色體dna和蛋白質變性,將質粒dna釋放到上清中。

儘管鹼性溶劑使鹼基配對完全破壞,閉環的質粒dna雙鏈仍不會彼此分離,這因為它們在拓撲學上是相互纏繞的。只要用鹼處理的強度和時間不要太過,當ph值恢復到中性時,dna雙鏈就會再次形成。

在裂解過程中,細菌蛋白質、破裂的細胞壁和變性的染色體dna會相互纏繞成大型複合物,後者被十二烷基硫酸鹽包蓋。當用k+取代na+時,複合物會從溶液中有效地沉澱下來,離心除去變性劑後,就可以從上清中**復性的質粒dna。

在sds存在的條件下,鹼水解是一項非常靈活的技術,它對e. coli的所有菌株都適用,並且其細菌培養物的體積可以從1-500ml以上。

擴充套件資料

鹼裂解法適用於小量質粒dna的提取,提取的質粒dna可直接用於酶切、pcr擴增、銀染序列分析。方法如下:

1、接1%含質粒的大腸桿菌細胞於2mllb培養基。

2、37℃振盪培養過夜。

3、取1.5ml菌體於ep管(離心管),以4000rpm離心3min,棄上清液。

4、加0.lml溶液i(1%葡萄糖,50mm/ledtaph8.0,25mm/ltris-hclph8.0)充分混合。

5、加入0.2ml溶液ii(0.2mm/lnaoh,1%sds),輕輕翻轉混勻,置於冰浴5min.

6、加入0.15m1預冷溶液iii(5mol/lkac,ph4.8),輕輕翻轉混勻,置於冰浴5min.

7、以10,000rpm離心20min,取上清液於另一新ep管

8、加入等體積的異戊醇,混勻後靜置10min.

9、以10,000rpm離心20min,棄上清。

10、用70%乙醇0.5ml洗滌一次,抽乾所有液體。

11、待沉澱乾燥後,溶於50ulte緩衝液中(或60℃溫育去離子水)

2樓:匿名使用者

鹼裂解法是較常用的提取的方法。其優點是收穫率高,適於多數的菌株,所得產物經純化後可滿足多數的dna重組操作。

十二烷基磺進行質粒的小量製備。十二烷基磺酸鈉(sds)是一種陰離子表面活性劑,它既能使細菌細胞裂解,又能使一些蛋白質變性。用sds處理細菌後,會導致細菌細胞破裂,釋放出質粒dna和染色體dna,兩種dna在強鹼環境都會變性。

由於質粒和主染色體的拓撲結構不同,變性時前者雖然兩條鏈分離,卻仍然纏繞在一起不分開;但後者完全變性分甚至出現斷裂,因此,當加入ph4.8的酸性乙酸鉀降低溶液ph值,使溶液ph值恢復較低的近中性水平時,質粒的兩條小分子單鏈可迅速復性恢復雙鏈結構,但是主染色體dna則難以復性。在離心時,大部分主染色體與細胞碎片,雜質等纏繞一起被沉澱,而可溶性的質粒dna留在上清夜中。

再由異丙醇沉澱、乙醇洗滌,可得到純化的質粒dna。

鹼裂解法提取的質粒dna可直接用於酶切、pcr擴增、銀染序列分析等。

3樓:匿名使用者

鹼裂解法是提取質粒的最常用也最有效的方法,是基於染色體dna與質粒dna的變性與復性的差異達到分離目的。

原理:高ph使質粒dna和染色體dna變性,同時沉澱蛋白質。再將ph值調至中性,質粒dna較小,很容易復性成雙鏈。

而染色體dna較大,不會復性,纏結成網狀不溶物質,從而可以通過離心除去。

方法:依次加入下面三種溶液:

溶液1: 葡萄糖 50 mmol/l,edta 100 mmol/l,tris-cl 25 mmol/l,溶菌酶5mg/ml,ph 8.0

溶液2: naoh 0.2 mol/l,sds 1%

溶液3: 5 mol/l kac 60 ml,冰乙酸 11.5 ml,重蒸水 28.5 ml

其中溶液1作用主要是懸浮菌體,溶液2作用是裂解菌體,釋放胞內物質,溶液3是沉澱染色體dna

鹼裂解法大量提取質粒是什麼原理?

4樓:匿名使用者

1濃度過高無法正常電壓。2提取過程因為某些因素使dna降解

鹼法分離質粒dna的原理是什麼?

5樓:淘歌

現在質粒提取無論手提還是試劑盒,其根本原理大多還是鹼裂解法:當菌體在naoh和 sds溶液中裂解時,蛋白質與dna發生變性,當加入中和液後,質粒dna分子能夠迅速復性,呈溶解狀態,離心時留在上清中;蛋白質與染色體dna不變性 而呈絮狀,離心時可沉澱下來。

進一步的質粒dna獲取,手提是經過苯酚、氯仿抽提,rna酶消化和乙醇沉澱 等簡單步驟去除殘餘蛋白質和rna以及過多的鹽分,而試劑盒則在此基礎上使用dna吸附柱來吸附質粒dna,在洗脫得到質粒。

評價:1,可通過瓊脂糖電泳來檢查所獲質粒的大小(準確大小需酶切),有無細菌基因組dna和rna汙染,以及質粒的斷裂多少,同時也可根據marke量對樣品進行大致的濃度定量;

2,通過紫外分光光度計測定樣品od280和od260,計算其比值來衡量樣品的純度。經驗值:純dna:

od260/od280≈1.8(>1.9,表明有rna汙染;<1。

6,表明有蛋白質、酚等汙染)。同時,用紫外分光光度計對其進行精確濃度定量。

去除蛋白質:如上所言,提取質粒過程中,一部分蛋白質會在鹼裂解法中形成沉澱,得以去除;還有更多不能形成沉澱的蛋白質在用酚/氯仿/異戊醇進行抽提的過程中被去除。

若有疑問,歡迎繼續討論,祝愉快!

6樓:匿名使用者

強鹼可以破壞細菌壁,並且切斷細菌dna,在破壞質粒dna之前中和之後,細菌殘骸和切斷的dna會和表面活性劑形成沉澱,通過離心分離,質粒留存在上清溶液中。

為什麼真核dna無法用鹼裂解法提取

7樓:祝略光孤晴

dna在鹼性條件下氫鍵會斷裂,提取質粒的ph值大約是12吧,我也記不清了。在這種情況下氫鍵理所當然的會斷裂,當然磷酸與核糖間的化學鍵也會斷一些。

提取質粒一般用的是大腸肝菌。

大腸肝菌的質粒dna和染色dna都會發生上述情況,但由於質粒是環狀結構,雖然dna也會變性斷裂氫鍵,但螺旋結構卻基本不會被破壞,也就是兩條單鏈環還是絞在一起。而染色dna的兩條鏈卻分開了。然後降低ph,應該是降到5左右,我記不清楚了。

質粒的兩條鏈之間的氫鍵又會複合,而染色dna的兩條鏈卻不像質粒那般複合,眾多的染色dna會形成網狀結構,沉澱下來。從而得到質粒dna。

真核生物的dna為線狀的,也會象上面的那樣不能得到完整的dna。

8樓:伊玉花以念

鹼裂解法只能提取質粒,因為質粒是環形雙鏈比較好恢復,而基因組就無法復性了。

基因組dna只能用表面活性劑法。

9樓:修秋英希詩

因為真核細胞dna上有蛋白質結合,如果用鹼裂解法就會把dna與蛋白質一起沉澱下去,無法分離出細胞核dna!

鹼裂解法提取質粒dna,原理是細胞內蛋白質在沉澱的過程中會把大的dna分子一起沉澱下去,質粒dna由於較小,不會被沉澱而進入上清液,因而可以通過離心將其分離出來!

然而真核dna與組蛋白緊密結合,無法用鹼裂解法提取出來!