分子動力學模擬可以得到系統的哪些性質

時間 2021-08-11 17:49:43

1樓:匿名使用者

理論上說,只要計算時間允許,現在已經可以模擬化學研究領域內從飛秒到微秒、從皮米到微米的幾乎所有過程,得到的體系性質也多種多樣:

最基本的就是一些熱力學性質,例如溫度、內能、壓強、焓等等,直接根據速度和勢能計算。

接下來是基本的結構資訊,就是一定溫度**系的動態平衡結構,如蛋白質在溶液中的形態、溶劑化層中水分子距離和取向分佈、高分子鏈的均方末端矩和均方回轉半徑等等。

運用熱力學積分、自由能微擾等一些特殊的方法,可以得到自由能f、g,進而得到熵。結合傘形取樣,可以得到體系完整的自由能面。

運用昂薩格的近平衡態熱力學理論,可以得到體系的一些動力學性質,例如擴散係數、粘度、導熱係數等等。

用從頭算的動力學模擬可以全面模擬微觀反應性,例如分子的電荷密度分佈、催化劑表面的催化效能、化學鍵的動態強度、電子或軌道的路易斯酸鹼性等等。

結合經典模擬方法,甚至可以得到反應速率常數和紅外光譜等一般無法由分子模擬直接得到的巨集觀資訊。

2樓:匿名使用者

可以得到系統中原子的刻蝕量、入射原子的沉積量、作用後的生成產物以及作用後的系統的形狀等等。

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