1樓:一分流水
1.典型的引物18到24個核苷長。引物需要足夠長,保證序列獨特性,並降低序列存在於非目的序列位點的可能性。
但是長度大於24核苷的引物並不意味著更高的特異性。較長的序列可能會與錯誤配對序列雜交,降低了特異性,而且比短序列雜交慢,從而降低了產量。
2.選擇gc含量為40%到60%或gc含量映像模板gc含量的引物。
3.設計5'端和中間區為g或c的引物。這會增加引物的穩定性和引物同目的序列雜交的穩定性。
4.避免引物對3'末端存在互補序列,這會形成引物二聚體,抑制擴增。
5.避免3'末端富含gc。設計引物時保證在最後5個核苷中含有3個a或t。
6.避免3'末端的錯誤配對。3'端核苷需要同模板退火以供聚合酶催化延伸。
7.避免存在可能會產生內部二級結構的序列,這會破壞引物退火穩定性。
2樓:呆瓜**社
如果是pcr引物的話。
如果你已經找到了這個基因,並且知道了序列的話。
可以直接使用引物設計軟體 或者。
如果ncbi裡面有的話。
可以直接在網頁裡面完成。
基因定位 如何設計引物
3樓:網友
建議你使用六聚體或者八聚體隨機引物做rapd看看,也能達到多型性分析的目的。
設計引物如何保證基因完整
4樓:zd混混
?問題很模糊呵。
如果擴基因用於表達,一般使用cdna做為模板,引物設計時要保證產物包含atg-tga的編碼序列,兩者常設計成直接在引物靠3』端,而5'端引入些酶切位點做下一步轉殖用。
設計即時定量pcr引物是根據基因的全長設計引物還是根據基因的開放閱讀框設計引物?
5樓:浦恐
你的real time pcr擴增的是cdna啊,因此用cds序列啊。
如何在知道基因片段的情況下,設計引物?
6樓:網友
一條引物應該與a鏈一端的序列一致;令一條引物應該與b鏈在令一端的序列一致。走向應該都是從5』到3『向基因內部走。
為什麼在基因轉殖中,除開設計pcr引物還要設計表達基因引物?
7樓:得意兒的一撥一
構建載體需要酶切的,所以需要加接頭的!
8樓:網友
不明白你在問什麼 pcr引物不就是用來把基因擴增出來的麼 表達引物是什麼意思 檢測基因是否表達麼 那就是real time引物了吧 對產物長度和特異性有更高要求咯。
dna引物溶液怎樣配置
9樓:浙大阿公尺巴
合成公司交給你的引物成品一般是會註明有幾個od。正常一管引物乾粉都是1個od,相當於33μg。
因為引物溶液濃度一般要求是10μmol/l,所以首先要計算引物的摩爾數,鹼基平均分子量,如果你的引物長度是n,那麼引物摩爾數就是33÷n÷。
比如你的引物長度是24個bp,摩爾數就是33÷24÷,也就是說要加入420μl的雙蒸水就能配成10μmol/l的引物溶液。
加入水前記得先要在離心機上把引物管5000轉以上轉2分鐘,把乾粉都甩到底部,以免開啟的時候飄散。
10樓:johnny王子
用1×te,或是無菌水就哦了,然後按照說明,配成20或10p的。
乙個基因的表達量在花中較葉中的量很少,我取花作為材料,會影響設計的引物與這個基因的擴增量嗎
11樓:網友
看錶達量用rna,如果表達量很少,肯定檢測得到的量就會很少的。引物設計瞭如果在葉中可以擴出來,那麼在這個品種裡面就是特異的。做rt-pcr就是要看出表達量的差異,你不不是要達到這個目的麼。
12樓:網友
pcr反應本來就是倍增基因的,理論上只要dna量大於實驗閾值,均可通過增加迴圈數來增加擴增量,但是迴圈數增加後非線性擴增的幾率也會增加。
給出dna序列怎麼設計引物
13樓:網友
這問碰猛喊題都上知道來問了,你也是生物專業的知手研究生笑野吧。primer premier 5這個軟體設計引物用很不錯的。
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