血漿dna提取試劑盒濃度一般多少

時間 2021-05-07 20:01:30

1樓:匿名使用者

血清/血漿dna提取試劑盒濃度跟樣本量、洗脫體積有關,一般來說用qiagen、biog方法得率都差不多,50微升洗脫體積可以用qbit測到5-20ng/ul的讀數,濃度稍低也沒關係,關鍵還是看pcr檢測結果,畢竟濃度太低測到的讀書也沒有參考意義,還是要以pcr檢測結果為準。

2樓:名傑**

要看你做什麼用途了,血漿中的遊離dna本身就很少的,我用過天根和杭州昊鑫生物這兩家的血漿遊離dna提取試劑盒,總的來說,兩家的效能,杭州昊鑫生物的純度和提取量要略好一點,後續檢測的pcr結果也好一點,ct值比天根的要早3個迴圈左右,而且,杭州昊鑫生物的試劑盒提取耗時短,比較適合樣本多的使用者。

3樓:匿名使用者

血液遊離dna(又稱血液迴圈dna)是指血液中游離於細胞外的dna,其**主要有三:白細胞崩解釋放的dna、壞死組織特別是腫瘤組織釋放入血液的dna和感染病毒、細菌的dna。近幾年來,隨著基因診斷技術的發展,遊離核酸的應用價值越來越大,如優生篩查、腫瘤早期診斷、遺傳病檢測和病原體感染基因檢測等。

但血液中游離dna含量一般較低,片段較小,不易提取,這大大影響了遊離核酸的基因檢測和各種研究的開展。

遊離dna提取方法一般有trizol方法、離心柱法、磁珠法。其中,trizol方法與離心柱相比,提取效果相當,但是因其對操作者帶來的毒性,現在越來越被棄用。磁珠法比較適合機器自動化提取,如果沒有核酸提取儀,只是使用磁力架配套提取,磁珠法的操作就比較麻煩且容易導致樣本交叉汙染。

另外,根據研究,磁珠法的核酸提取得率不如離心柱法。如果要提取的遊離核酸的量比較低,最好選擇離心柱法。對於遊離dna含量較低的樣本或比較珍貴的樣本或樣本總數不是很多的實驗室,首選的核酸提取方法應是離心柱法。

離心柱法遊離dna提取原理主要是樣本裂解後,dna在高鹽條件下與矽膠膜結合,再在低鹽、高ph值時將dna從矽膠膜上洗脫下來。面對各種品牌的離心柱法提取試劑盒,哪種才是最適合的呢?目前國內常用的離心柱法遊離dna提取試劑盒有國內品牌biog、國際品牌q、國內品牌t等。

我們以下就幾種遊離dna提取試劑盒進行比較。

一、有較高的提取得率。核酸提取得率的確定,常用的是使用紫外分光光度計的方法。但是,血清、血漿樣本中游離核酸含量較低,如果直接用紫外法檢測,得出的數值並不準確,而且多次測量的結果會變異很大。

關於提取得率,qiagen的研究資料是1ml正常血漿樣本cfdna得為7.35ng左右,但如果白細胞大量凋亡,血漿中的遊離dna量會有所增加,腫瘤病人血漿中的dna會大幅增加。有些研究者提取血漿核酸後習慣於先用紫外檢測濃度,發現紫外檢測不出來或濃度很低時便認為提取失敗,放棄後面進一步的實驗,其實並不可取。

我們可以把紫外讀數作為參考,但是不能作為判斷得率的唯一標準,最好還是要做個pcr或熒光定量。根據qiagen公司的實驗,血清血漿的量與提取的核酸量成正比。因而,如果要提高核酸得率,可通過增加血清或血漿的量來實現。

一般地,做血漿或血清核酸提取,樣本量最好在1ml以上。如果1ml或更大量樣本得不到滿意的檢測結果,則應及時考慮更換提取試劑盒。目前國內常用的血漿核酸提取試劑有國際品牌q、國內品牌t、國產品牌biog等,我們實驗室使用下來,biog的核酸提取得率較高,1ml肺癌病人血漿樣本dna得率在85ng左右,q的得率在72ng左右,t的得率在63ng左右,基本上都能滿足下游pcr實驗的需求。

當然,如此低的濃度直接測od值不太容易,如果使用nanodrop2000c,其檢測下限為2ng/ul。如洗脫液為30ul,則需要1ml左右的血漿才能檢測出來。顯然,如果是健康人的血漿,1ml血漿的dna濃度更低,紫外可能根本就檢測不出來。

因而,血漿dna提取完成以後,最好直接做pcr,紫外檢測的意義不大。

二、提取的核酸純度高。核酸純度一般根據od260/od280比值來判斷。一般說來,試劑盒提取的dna 其od260/od280比值應在1.

6--1.8之間。如果提取的dna溶液od260/od280比值小於1.

6,通常說明有蛋白質或酚、多糖等的汙染。如果提取的dna溶液od260/od280>1.9,則表明有rna汙染。

使用q公司血漿dna提取試劑盒提取的血漿dna, od260/od280一般在1.7-1.9之間;使用biog血漿遊離dna提取試劑盒提取的血漿dna, od260/od280一般在1.

6-1.9之間,使用t公司血漿dna提取試劑盒提取的血漿dna od260/od280比值也在1.6-1.

9之間。q公司提取dna的純度似乎優於國產試劑,但我們提取的dna是用於pcr檢測,結果並無明顯影響。可能因為b公司血漿遊離dna提取試劑盒提取的血漿dna量得率較高的原因,同樣的dna加樣體積(2ul),biog試劑盒提取的dna 熒光定量pcr檢測結果ct值要小於q公司試劑盒提取的dna。

三、操作簡便性。操作簡便性也是血漿dna提取試劑選擇的一個重要因素。操作過於複雜,不僅費時費力,還容易導致樣本間的交叉汙染,也容易損失樣本。

特別是用於臨床檢測或樣本較多情況下的檢測,操作複雜如果導致交叉汙染會引起誤診,還會影響出檢測報告的時間。因而,選用操作簡便、流暢的提取試劑盒非常重要。就我們曾經用過的以上三種提取試劑盒來說,q公司的血漿dna提取試劑盒提取過程大約30min,從樣本處理開始需要個10步驟;t公司血清/血漿遊離dna提取試劑盒整個提取過程需要約40min,從樣本開始處理10個步驟;b公司的biog血漿遊離dna提取試劑盒提取過程大約25min,從樣本開始處理8個步驟,b公司的血漿遊離dna提取試劑盒在操作簡便性上具有一定優勢,更適合於較多樣本的檢測。

據瞭解,該產品已通過藥監局備案,也更適合臨床樣本的檢測。

綜合看來,與國外知名品牌相比,國產試劑盒在血漿dna提取純度上稍有不足,但在提取得率和操作簡便性上基本沒有區別,有些品牌還略有優勢,可根據實驗需求進行選擇。對純度要求較高的實驗,可選擇q等國外知名品牌,如果對提取量要求較高或提取後主要進行pcr或分子雜交之類的實驗,可考慮選擇biog等國產品牌。

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