1樓:定芷太叔貞婉
高解析度高靈敏度質譜通常都大幾百萬甚至上千萬人民幣的,如果你用商業的資料分析軟體比如mascot等,資料處理方法,質譜只是基於資料庫比對的方式來鑑定蛋白質:質譜技術很少能做氨基酸測序的(少部分如maldi
toftof的in-source
decay技術貌似可以),樣品處理方式;第二
2樓:匿名使用者
很少人會用質譜來做蛋白質的氨基酸測序的,一般是根據資料庫來鑑定蛋白質種類或者定量蛋白質相對或者絕對量。
測序,更多是用edman降解法
3樓:匿名使用者
基於質譜的蛋白分析成本主要取決於兩個方面:第
一、質譜儀及其聯用裝置的型別,高解析度高靈敏度質譜通常都大幾百萬甚至上千萬人民幣的;第二,資料處理方法,如果你用商業的資料分析軟體比如mascot等;第三,樣品處理方式,是簡單鑑定還是相對定量或者絕對定量。ps:質譜技術很少能做氨基酸測序的(少部分如maldi tof tof的in-source decay技術貌似可以),質譜只是基於資料庫比對的方式來鑑定蛋白質,edman降解才是測序的
質譜儀是怎麼測蛋白質序列的,過程是什麼??
4樓:自然之一水無痕
基本過程是將蛋白復質被打製成單電荷片段,通過電磁偏轉得到一系列長度不等的片段,由於可測得質量,將片段排序,就可知道某個位點的氨基酸的質量,進而得知氨基酸的種類,重複此過程,可得知所有氨基酸的種類,進而得知蛋白質的序列,一般都是以及序列的資訊,畢竟蛋白質測序之前要經過預處理。
5樓:匿名使用者
根據氨基酸的亞基不同來測吸收峰的不同,從而確定蛋白質中的氨基酸殘基的序列
6樓:匿名使用者
沒聽說質譜儀可以直接測蛋白質序列。。。。
請教蛋白質質譜測序 10
7樓:匿名使用者
如果是蛋白質的話,我想用質譜測序會有難度吧?你再查一下,確定是不是質譜測序呢?在我印象裡,只有小分子的蛋白質也就是多肽才可以用質譜通過碎片拼接初步推測一下它的序列,更精確的序列都需要用水解氨基酸的方法來驗證,質譜只是一個輔助工具,用它測序,準確度無法保障!
再說蛋白質包含那麼多的氨基酸,從理論上說,質譜根本不可能精確的得到每個氨基酸的序列的!
如何**一個新基因編碼蛋白的氨基酸序列
8樓:鵝子野心
如何**一段多肽鏈的氨基酸序列
有兩種方法,一是直接測序列法,常用edman降解專法,在弱鹼性屬條件下多肽連n端氨基酸(阿爾發)與pitc反應,標記為苯氨基硫代甲醯蛋白質。肽鏈中的第一個肽鍵變弱,在無水酸的存在下發發生降解,第一個氨基酸(aa1)經過分子重排成為pth-aa1結合層析技術即可確定氨基酸的性質。c端氨基酸殘基分析,可用;羧基肽酶,肼解法;二是串聯質譜測定多肽鏈氨基酸測序。
氨基酸(amino acid):含有氨基和羧基的一類有機化合物的通稱。生物功能大分子蛋白質的基本組成單位,是構成動物營養所需蛋白質的基本物質。
是含有鹼性氨基和酸性羧基的有機化合物。氨基連在α-碳上的為α-氨基酸。組成蛋白質的氨基酸均為α-氨基酸。
多極質譜進行蛋白質多肽測序的原理是什麼 5
9樓:十張樹
根據一級質譜可以測得多肽整體的分子量,多肽碎裂時會產生一系列在肽鏈不同位置斷裂而形成的碎片離子,可以得到多肽的二級譜圖,根據二級質譜相近譜峰之間的質量數之差可以推算出對應的氨基酸序列。
由兩個氨基酸分子脫水縮合而成的化合物叫做二肽,同理類推還有三肽、四肽、五肽等。通常由10~100個氨基酸分子脫水縮合而成的化合物叫多肽。
10樓:倉鼠肥肥仔
分離不同質荷比的帶電基團,每級質譜都會產生新的碎片並且能篩選一次(通過高溫氮氣碰撞),通過對照譜庫的特徵離子來確定樣品的情況。
11樓:匿名使用者
質譜儀是利用電磁學原理,使帶電
的樣品離子按質荷比進行分離的裝置。
離子電離後經加速進入磁場中,其動能
與加速電壓及電荷z有關,即
zeu=1/2 mv*v
12樓:匿名使用者
zeu=1/2 mv*v
蛋白質質譜分析
13樓:匿名使用者
你說的很對,質譜分析只是檢測蛋白消化後的所有肽段的質量,然後跟已知的蛋白指紋進行比較,確定可能的蛋白種類。因此,質譜能檢測出是未知蛋白,但是無法確定具體的氨基酸序列。
測定蛋白質的構型和功能要用什麼儀器,有哪些步驟
14樓:基雲生物
你好,很高興回答你的問題。
構型這個概念是指 一個有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。這種排列不經過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。構型的改變往往使分子的光學活性發生變化。
蛋白質的構型就是一級結構,指其氨基酸排列順序。
測定蛋白質的構型的主要有兩種方法:edman降解(edman degradation)和質譜法。
edman降解法測序是經典的方法,通過從多肽鏈遊離的n末端(或者c末端,但是很少)測定氨基酸殘基的序列的過程。n末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然後從多肽鏈上切下修飾的殘基,現在一般都是自動測序儀。
質譜法測蛋白只要是利用生物質譜儀,比如esi-q-tof,esi-it-obitraq。利用特異的酶將蛋白切成肽段, 然後通過質譜方法進行測定,產生資料或通過重頭比對,或者通過生物資訊學中資料庫搜尋的方法推斷出肽段序列,然後再由肽段序列拼接處蛋白序列。這種方法是近些年來隨著蛋白質組學的發展而廣泛被使用,但是對於蛋白完整序列測定需要較強的生物資訊學技術。
整體而言, edman降解法準確, 但是耗時長, 而且對於所測定的肽段要求很高, 不能太長, 不能太難修飾等等, 一般能測個20-50鹼基不錯了。而質譜法方法快速,但是準確性比edman降解法略差。
另外,樓主講的蛋白功能測定,不同的蛋白質功能各異,蛋白功能主要通過生物學實驗反覆驗證次得到,這個比較複雜,沒有固定的模式,要逐一研究。
另外,像核磁儀可以用來研究蛋白的構象或者說晶體結構,表面等離子共振儀器可以用來研究蛋白蛋白相互作用,等等,蛋白質是未來有限的生物研究資源,現在全世界對蛋白質的研究熱情都很高。也有許多相關的基礎科教書,樓主感興趣可以去看看。
純手工打造,希望採納哦。
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