熒光定量pcr的擴增效率e多少算好

時間 2021-05-07 20:01:14

1樓:鮑希榮鞠嫣

擴增效率理論上不可能超過2。計算值超過2,可能是因為pcr效率不高或者不穩定,結果線性度差,導致某個區間的資料點計算出來的擴增效率反而大於2.這樣的標準曲線如果作圖的話,資料點都不在一條直線上。

一般都是試劑擴增效率有問題,離子濃度不對,或者酶比較劣質。也有可能是引物不好。可以先換一對已知有效的引物,比如常見的內參的已驗證引物,如果用同樣的試劑和體系能做出好的曲線,e接近2,那就是引物問題,如果這樣也做不出來,就換試劑。

僅供參考,我很少做外標曲線,只有偶爾更換試劑體系的時候會做個梯度,一般曲線不好的話,取的資料點不同,e值會忽高忽低。整個線就是歪的。基本上都是試劑有問題。

引物擴增片段不超過500bp應該不會影響擴增效率。你先把pcr產物電泳看看有沒有問題,條帶沒問題,基本上引物就問題不大。

2樓:蕭霞齊儀

abi的儀器是接近100%最好,羅氏的是接近2最好,這個要看具體的機型。但是數值的表示當時可能不一樣,但是換算之後肯定都是接近100%最好。也就是每一輪擴增迴圈後,產物的量加倍

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